Direktur Pascasarjana dari Waktu ke Waktu Direktur Pascasarjana I 1994-1997 Prof. Dr. H. Harun Nasution, Ph.D Direktur Pascasarjana II 1997-2001 Prof. Dr. H. Thoha Hamim, MA., Ph.D. Direktur Pascasarjana III 2001-2005 Prof. Dr. KH. Sjeichul Hadi Permono, SH, MA. Direktur Pascasarjana IV 2005-2009 Prof. Dr. H. Ahmad Zahro, MA Direktur Pascasarjana V 2009-2013 Prof. Dr. H. M. Ridwan Nasir, MA. Direktur Pascasarjana VI 2013-2018 Prof. Dr. H. Husein Aziz, M.Ag. Direktur Pascasarjana VII 2018-2022 Prof. Dr. H. Aswadi, M.Ag.